Növényi Stresszbiológia Csoport

Növényi Stresszbiológia Csoport részletes bemutatása

A csoport részletes bemutatása

A csoport a növényi hőstressz adaptáció témán dolgozik, melyek alapkutatási és alkalmazott kutatási feladatokat is tartalmaznak. A csoportban 1 főmunkatárs, 2 PhD hallgató, 1 szakdolgozó dolgozik.


Kutatási témák rövid bemutatása

  1. Egy konzervált nem-kodoló RNS-család szerepének vizsgálata a zárvatermők megtermékenyítésében (NKFIH 137722);

    Állatokban és növényekben is kimutatták, hogy a fehérjét nem kódoló gének avagy hosszú nem-kódoló RNS-ek (long non-coding RNA, lncRNS) fontos szerepet játszanak a különböző stresszválaszok szabályozásában. Annak ellenére, hogy számos lncRNS-t azonosítottak, a funkcionálisan jellemzett lncRNS-ek száma elenyésző. A növényi lncRNS-ek szerepe a HS-válaszban egyáltalán nem ismert vagy vizsgált. Munkánkban szeretnénk azonosítani HS-válaszban szerepet játszó növényi lncRNS-eket, igazolni biológiai jelentőségüket és megvizsgálni működésük molekuláris mechanizmusait. Mindemellett, a lncRNS-ek számos egyéb fontos génszabályozó útvonalban is résztvesznek, beleértve a fejlődésbiológiai folyamatokat vagy különböző betegségek kialakulását. Meggyőződésünk, hogy az általunk szerzett adatok hozzájárulhatnak a lncRNS-ek alaposabb megismeréséhez, ami fontos lehet egyéb, eukarióta rendszerek működésének és adaptációjának megértésében is.
  1. (ii) A hőstressz transzkripcionális és epigenetikai szabályozása káposztafélékben (NKFIH K129283).

    Jelen kutatásban a hőstressz specifikus transzkripciós komplex összetételét és szabályozásának megértését tűztük ki célul. A projekt konkrét céljai (i) tanulmányozni és megérteni a HSFA1 és A2 paralógok transzkripcionális szabályozását és igazolni ezek biológiai fontosságát repcében, (ii) megkeresni a HS-specifikus transzkripciós komplex kofaktorait és igazolni működésük fontosságát, és (iii) felfedezni azokat az epigenetikai tényezőket, amelyek szükségesek és hozzájárulnak a hőstressz-specifikus transzkripciós komplex szabályozásához. Mindez hozzásegít a HS molekuláris mechanizmusainak alaposabb megértéséhez és betekintést nyújt a HS válaszok evolúciójába is káposztafélékben. Mindemellett, a munka során adaptálni fogjuk a CRISPR technológiát repce mutánsok, komplementált és overexpressziós vonalak előállítására. Ezek a vonalak eszközként szolgálnak majd a HS komponensek működésének és az episztatikus kölcsönhatásaiknak a megértéséhez. Munkánkkal hozzájárulunk a HS válaszok molekuláris mechanizmusainak jobb megértéséhez. Hosszútávon mindez felgyorsíthatja a hőstressz-toleráns repcevonalak előállítását.


Csoport főbb publikációi:

NODULIN HOMEOBOX is required for heterochromatin homeostasis in Arabidopsis.Karányi Z, Mosolygó-L Á, Feró O, Horváth A, Boros-Oláh B, Nagy É, Hetey S, Holb I, Szaker HM, Miskei M, Csorba T, Székvölgyi L. (2022) Nat Commun. 2022 Aug 27;13(1):5058. doi: 10.1038/s41467-022-32709-y.

Elongation factor TFIIS is essential for heat stress adaptation in plants.Szádeczky-Kardoss I, Szaker HM, Verma R, Darkó É, Pettkó-Szandtner A, Silhavy D, Csorba T. (2022) Nucleic Acids Res. 2022 Feb 28;50(4):1927-1950. doi: 10.1093/nar/gkac020

Genome-Wide Identification of RNA Silencing-Related Genes and Their Expressional Analysis in Response to Heat Stress in Barley (Hordeum vulgare L.).
Hamar É, Szaker HM, Kis A, Dalmadi Á, Miloro F, Szittya G, Taller J, Gyula* P, Csorba* T, Havelda* Z.
Biomolecules. 2020 Jun 18;10(6):929. doi: 10.3390/biom10060929.

APOLO lncRNA, a self-calibrating switch of root development.
Csorba* T.
Mol Plant. 2021 Jun 7;14(6):867-869. doi: 10.1016/j.molp.2021.05.015.

Differential gene expression and physiological changes during acute or persistent plant virus interactions may contribute to viral symptom differences.
Pesti R, Kontra L, Paul K, Vass I, Csorba T, Havelda Z, Várallyay É.
PLoS One. 2019 May 3;14(5):e0216618. doi: 10.1371/journal.pone.0216618.

miR824/AGAMOUS-LIKE16 Module Integrates Recurring Environmental Heat Stress Changes to Fine-Tune Poststress Development.
Szaker HM, Darkó É, Medzihradszky A, Janda T, Liu HC, Charng YY, Csorba T*.
Front Plant Sci. 2019
Nov 25;10:1454. doi: 10.3389/fpls.2019.01454.

The nonstop decay and the RNA silencing systems operate cooperatively in plants.
Szádeczky-Kardoss* I, Csorba* T, Auber A, Schamberger A, Nyikó T, Taller J, Orbán TI, Burgyán J, Silhavy D.
Nucleic Acids Res. 2018 May 18;46(9):4632-4648. doi: 10.1093/nar/gky279.

Distinct Effects of p19 RNA Silencing Suppressor on Small RNA Mediated Pathways in Plants.
Kontra L, Csorba T*, Tavazza M, Lucioli A, Tavazza R, Moxon S, Tisza V, Medzihradszky A, Turina M, Burgyán J*.
PLoS Pathog. 2016 Oct 6;12(10):e1005935. doi: 10.1371/journal.ppat.1005935.

viral silencing suppressors: Tools forged to fine-tune host-pathogen coexistence.
Csorba T*, Kontra L, Burgyán J.
Virology. 2015 May;479-480:85-103. doi: 10.1016/j.virol.2015.02.028.

Antisense COOLAIR mediates the coordinated switching of chromatin states at FLC during vernalization.
Csorba T, Questa JI, Sun Q, Dean C.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Nov 11;111(45):16160-5. doi: 10.1073/pnas.1419030111.

R-loop stabilization represses antisense transcription at the Arabidopsis FLC locus.
Sun Q, Csorba T, Skourti-Stathaki K, Proudfoot NJ, Dean C.
Science. 2013 May 3;340(6132):619-21. doi: 10.1126/science.1234848.

Polerovirus protein P0 prevents the assembly of small RNA-containing RISC complexes and leads to degradation of ARGONAUTE1.
Csorba T, Lózsa R, Hutvágner G, Burgyán J.
Plant J. 2010 May;62(3):463-72. doi: 10.1111/j.1365-313X.2010.04163.x.


Csoport főbb pályázatai:

csak 2021-ben még futó, illetve 2021-ben, 2022-ben induló pályázatok

  1. A hőstressz transzkripcionális és epigenetikai szabályozása káposztafélékben (NKFIH K129283, témavezető: Csorba Tibor, 2018-2022).
  2. ​​​​​​​Egy konzervált nem-kodoló RNA család szerepének vizsgálata a zárvatermők megtermékenyítésében (NKFIH 137722, témavezető: Csorba Tibor, 2021-2025)


​​​​​​​A csoport tagjai

Szádeczky-Kardoss István, tudományos segédmunkatárs, PhD hallgató
MATE, GBI, Növénybiotechnológia tanszék, Növényi Stresszbiológia csoport, 2021-
mtmt

​​​​​​​MSc: Mezőgazdasági biotechnológus, Corvinus egyetem, Kertészettudományi kar, 2014
KUEP/TUEP: időpont
PhD iskola: Pannon egyetem, Festetics DI, 2014-
Mentor/témavezető: Dr. Taller János, Dr Silhavy Dániel

Telefon: +36-28/430-494 / 4154
Iroda: MATE GBI Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4., 1 emelet, 105 szobaszám
E-mail: Szadeczky-Kardoss.Istvan@uni-mate.hu

Radhika Verma, tudományos segédmunkatárs, PhD hallgató
MATE, GBI, Növénybiotechnológia tanszék, Növényi stresszbiológia csoport, 2020-2024

MSc: Biotechnology, Visva-Bharati Central University, Santiniketan, West Bengal, India, 2017-2019
PhD iskola: MATE egyetem, Biológia doktori iskola, 2020-2024
Mentor/témavezető: Csorba Tibor

Telefon: +36-28/430-494 / 4154
Iroda: MATE GBI, Gödöllő, Szent-Györgyi A. u. 4., I emelet, 105
E-mail: vermaradhika1228@gmail.com

Szakdolgozók: Gál Nóra, Biológia MSC, MATE, 2021-2022
Volt munkatársak: Szaker Henrik Mihály (2016-2021)